（1）“科学家发现胃蛋白酶只能催化蛋白质分解”，说明酶催化作用具有专一性；

　　（2）“毕希纳从死亡的酵母细胞中提取出一种物质，也能催化发酵”，因此了毕希纳实验证实了酶是无生命的化学物质；

　　（3）A、“毕希纳从死亡的酵母细胞中提取出一种物质，也能催化发酵”，表明酶在细胞外也能起作用，而不是酶只能在细胞内起作用，错误；

　　B、酶有催化作用，大多数酶是蛋白质，正确；

　　C、科学的发现是一个不断完善、不断修正的过程，正确．

　　因此关于酶发现过程的描述正确的是酶有催化作用，大多数酶是蛋白质、科学的发现是一个不断完善、不断修正的过程，故选BC

　　故答案为：（1）专一性

　　（2）酶是无生命的化学物质

　　（3）BC