①有氧呼吸的主要场所是线粒体．细胞色素C是真核生物细胞内，在有氧呼吸过程中起重要作用的一种蛋白质，据此可知细胞色素C主要分布在真核生物细胞的线粒体中．

　　②研究生物的进化时用到的最常见的方法是比较法．从上表看，人和酵母菌细胞色素C中有差异的氨基酸较多的亲缘关系最远，从表中数据可发现生物的细胞色素C的氨基酸组成和生物的亲缘关系是：亲缘关系越近，细胞色素C的氨基酸组成差异越（小）．

　　③脊椎动物的进化过程：鱼类→两栖类→爬行类→鸟类、哺乳类．鱼类是最低等的脊椎动物，而哺乳类中的灵长目动物（如大猩猩）则是自然界中最高等的动物了．爬行类在进化中，有一部分进化为善飞的鸟类，有一部分进化为更加适应陆地生活的哺乳类．

　　④在相对较短的地质时间内，从一个线系分枝出许多歧异的分类单元叫做辐射．由于辐射分枝通常是向不同的方向适应进化的，所以又称为适应辐射．故“适应辐射”现象是不同的环境从不同的方向选择着生物的变异，使生物的变异朝着不同的方向积累，生物的性状逐渐产生分歧，最后形成多样性的物种的结果．“适应辐射”现象说明生物进化具有生物的进化向着多样化和复杂化方向发展的规律．

　　⑤现代生物进化理论是建立在达尔文的自然选择学说的基础之上的．现代生物进化理论是达尔文的自然选择学说的进一步发展和完善．达尔文自然选择学说以生物个体为基本单位现代生物进化理论以种群为生物进化的基本单位．达尔文自然选择学说不能解释遗传变异的本质，现代生物进化理论则解决了该问题．现代生物进化理论的主要思想是：种群是生物进化的基本单位；突变和基因重组为生物的进化提供原材料；自然选择决定生物进化的方向；隔离是导致新物种形成的必要条件．现代综合进化论与达尔文自然选择学说的共同观点是：变异为进化提供了原材料；自然选择决定生物进化的方向．

　　故答案为：

　　①线粒体

　　②亲缘关系越近的生物，组成细胞色素C的氨基酸的差别就越小，反之则越大．

　　③爬行类→鸟类、哺乳类．

　　④不同的环境从不同的方向选择着生物的变异，使生物的变异朝着不同的方向积累，生物的性状逐渐产生分歧，最后形成多样性的物种

　　生物的进化向着多样化和复杂化方向发展．

　　⑤变异为进化提供了原材料；自然选择决定生物进化的方向．