（1）甲、乙两个小罐分别代表雌、雄生殖器官，小罐内的彩球D和d代表雌、雄配子．

　　（2）如果某同学按照正常方法取球，但是实验结果与理论推测差异较大，造成误差的原因可能是实验重复的次数少或桶内小球没有充分混合或抓取后的小球未放回桶内．

　　（3）由于雌、雄配子的数量不相同，一般雄配子多于雌配子，所以甲、乙两小罐的彩球数可以不相同．

　　（4）由于减数分裂产生D和d两种配子的比例是1：1，所以每个小罐中两种颜色的小球必须相同．

　　（5）①由于甲、乙中都有D、d，所以分别从甲、乙中各随机抓取一枚棋子，只能获得D或d中的一个，说明等位基因的分离，①正确；

　　②同源染色体的联会是指在减数第一次分裂前期，同源染色体之间的配对，所以随机抓取一枚棋子没有体现同源染色体的联会，②错误；

　　③分别从甲、乙中各随机抓取一枚棋子，不同字母的随机结合，模拟生物在生殖过程中，雌雄配子的随机组合，③正确；

　　④实验中只有一对基因，不可能发生非等位基因的自由组合，④错误．

　　所以正确的有①③．故选：A．

　　故答案为：

　　（1）雌、雄生殖器官

　　（2）实验重复的次数少

　　（3）可以    雌、雄配子的数量可以不相同，一般雄配子多于雌配子

　　（4）不可以   产生D和d两种配子的比例是1：1

　　（5）A