解（1）小雨通过观察比较纸盒移动的距离来比较小球动能的大小，这种科学研究的方法叫转换法，

　　A、磁感线实际不存在，是人们为形象地描述磁场分布而假想出来的，属于建立模型法．此选项不符合题意；

　　B、在研究分子间存在间隙的实验中，比较黄豆和芝麻混合前后的体积，根据体积减小得出分子之间有空隙，是通过实际实验得出的，所以不符合题意；

　　C、研究压力的作用效果与受力面积的关系时控制压力的大小相同，属于控制变量法，此选项不符合题意；

　　D、电流看不见、摸不着，判断电路中是否有电流我们可以通过电路中的灯泡是否发光去确定，属于转换法，此选项符合题意；

　　故选D．

　　（2）要研究动能与质量的关系，要保持两球的速度相等，即处于相同的高度滚下，我们应选择甲图和乙图来进行比较．

　　（3）比较图甲与图丙两实验可看出，此时小球的质量相同，但从不同的高度释放，其滚动到斜面低端的速度不同，推动纸盒的距离也不相同，故能得出：在质量相同时，物体的速度越大，动能就越大的结论；

　　（4）如果纸盒与小球碰撞的侧面过于柔软，小球撞击纸盒，纸盒要发生形变，需要消耗部分机械能，因而纸盒的移动的距离会偏小．

　　故答案为：（1）D；（2）乙；（3）在质量相同时，物体的速度越大，动能就越大；（3）纸盒的形变需要消耗部分机械能．