由于生物体内的DNA及RNA在转录表达和发挥其他作用时,往往是有一定的顺序的,因此在研究它们之前应当先确定这条DNA（RNA）的方向,即是从5'端开始研究还是从3'端开始.通常DNA在复制时,复制的酶都是沿着模板链从5’向3‘方向移动,即由此复制出来的子链是由3’向5'合成.同样,DNA转录为mRNA等的时候也有是有方向的.确定了正确的5'和3‘端并且确定相应的方向,才能正确的“阅读”出这条链的信息.