A、根据化学元素汉字名称的偏旁可辨别元素的种类，金属元素名称一般有“金”字旁，钇元素属于金属元素，故说法错误；

　　B、稀土元素钇在元素周期表中原子序数为39，根据核电荷数=原子序数可知，钇元素的核电荷数为39，故说法错误；

　　C、钇在元素周期表中原子序数为39，相对原子质量为89，根据质子数=原子序数可知，钇元素的质子数是39，根据相对原子质量=质子数+中子数可知，钇元素原子核内的中子数为89-39=50，故说法正确；

　　D、钇在元素周期表中原子序数为39，根据核外电子数=原子序数可知，钇元素原子的核外电子数是39，原子失去电子得到离子，因此钇离子的核外电子总数不是39，故说法错误．

　　故选：C．