A、化学反应的微观模型示意图，反应前后原子种类、数目没有变化，但却可看出原子结合方式发生改变，可判断是原子的重新组合的结果．故A分析正确；

　　B、由物质的微观构成可知，分子是由原子构成的．故B分析正确；

　　C、对比反应前后微粒的变化可知，该变化前后都含三种原子、原子个数均为9个原子，因此反应前后原子的种类和数目没有变化．故C分析正确；

　　D、由物质的微观构成可知，反应前的反应物中有由同种原子构成的单质分子两个，该分子构成的物质为单质．故D分析错误．

　　故选项为：D．