A．双原子分子中的共价键也可能是极性键，如HF，故A错误；

　　B．氕中只有质子而没有中子，故B错误；

　　C．离子化合物中一定含有离子键，可能含有非极性键，如Na2O2，存在O-O非极性键，属于离子化合物，故C正确；

　　D．具有相同质子数的原子一定属于同种元素，但微粒可能为原子、分子、离子等，如Na+、NH4+的质子数都是11，HF、Ne的质子数都是10，但不是同种元素，化学性质不同，故D错误．

　　故选C．