A、生物多样性通常有三个主要的内涵，即生物种类的多样性、基因（遗传）的多样性和生态系统的多样性，A错误；

　　B、引入世界各地不同的生物，由于该生物在我国没有天敌，会使该生物大量繁殖，无法控制，导致生物入侵，如水葫芦，B错误．

　　C、保护生态系统的多样性是保护生物多样性的根本措施．最有效的措施是建立自然保护区，错误．

　　D、生态系统是生物与环境构成的统一的整体，生态系统的多样性包括生物种类的多样性和生活环境的多样性，因此，生态系统的多样性受到影响时，会影响生物种类的多样性和基因的多样性基因的多样性，正确．

　　故选：D