（1）对人体健康有益的微生物也叫益生菌,包括酸奶中的乳酸链球菌、乳酸杆菌、双歧杆菌等,还有帮助消化的酵母菌.（2）工业和医药领域,一些微生物可以为人类生产很多产品,比如生产医药,酿酒,生产食品添加剂：柠檬酸、味精、乳酸等.（3）环境保护领域,微生物可以降解或转化污染物.（4）农业领域,微生物肥料和微生物农药是发展绿色农业必不可少的农资,益生菌也可以添加到饲料里,用于畜禽养殖.（5）微生物在生物能源领域中也有很大的用处,如：生产燃料乙醇、沼气、氢气等.