A、硝化细菌属于原核生物，霉菌和水绵属于真核生物，原核细胞和真核细胞都含有核糖体、DNA和RNA，A正确；

　　B、能进行有氧呼吸的细胞不一定含有线粒体，如醋酸菌等需氧型原核生物；含线粒体的细胞不是每时每刻都在进行有氧呼吸的，在无氧的情况下可进行无氧呼吸，B错误；

　　C、细胞分化的实质是基因的选择性表达，这不会使各种细胞的遗传物质有所差异，C错误；

　　D、蛙红细胞进行的是无丝分裂，没有细胞周期；人脑细胞已经高度分化，不再分裂，不具有细胞周期；洋葱根尖分生区细胞能连续进行有丝分裂，具有细胞周期，而且这些细胞内的化学成分都在不断更新，D正确．

　　故选：BC．