高中阶段的微生物分类可以有以下几种：

　　1、按照结构特点分类：

　　（1）真核生物,有以核膜包被的细胞核,核中的DNA与蛋白质结合在一起形成染色体,且细胞中含有各种细胞器.例如如酵母菌、霉菌、真菌（如蘑菇）；

　　（2）原核生物：细胞无核膜包被的细胞核,称为拟核,拟核中的DNA不与蛋白质结合形成染色体,且只有核糖体一种细胞器；

　　（3）病毒：如噬菌体、烟草花叶病毒等,病毒无细胞结构,无独立代谢系统,只能依赖于活细胞生存.

　　2、按照代谢类型分为自养需氧生物、异养需氧型、自养厌氧型和异养厌氧型.

　　3、按照在生态系统中的功能划分则分为生产者（如化能合成菌）、消费者（寄生的细菌、真菌或病毒等）、分解者（腐生细菌、真菌等）