蛋白酶体是所有真核生物中负责清除细胞内垃圾的除溶酶体以外的水解体系,蛋白酶体对蛋白质的降解通过泛素(ubiquitin)介导,所以又称为泛素降解途径.泛素是由76个氨基酸残基组成的小肽,它的作用主要是识别要被降解的蛋白质,然后将这种蛋白质送入蛋白酶体的圆桶中进行降解.蛋白酶体对蛋白质的降解作用分为两个过程:一是对被降解的蛋白质进行标记,由泛素完成;二是蛋白酶解作用,由蛋白酶体催化.

　　蛋白酶体是一个大的复合体催化机构,有不同的亚基组成的一个特定生物结构——圆桶状,具有特定的结构特征,识别同一种信号——泛素化,水解机制也是类似的.而蛋白酶泛指一切具有催化蛋白质水解功能的酶,具有不同的识别机制和水解机制.可以说,蛋白酶体是蛋白酶的一种