A、生物的生活环境不仅指生物的生存空间，还包括在于它周围的各种因素，A错误；

　　B、生物圈包括大气圈的底部、水圈的大部和岩石圈的表面，B错误；

　　C、环境中影响生物生活和分布的因素称为生态因素，可以分为非生物因素和生物因素．非生物因素包括：阳光、温度、水、空气、土壤等，C错误；

　　D、自然环境中，各种因素影响着生物，生物生存发展中不断适应环境，同时，也影响和改变着环境．如蚯蚓改良土壤，千里之堤毁于蚁穴，D正确．

　　故选：D