（1）据分析可知，①表示种群基因频率的改变，③表示自然选择学说．

　　（2）②表示可遗传的变异，包括基因突变、基因重组和染色体变异，为生物进化提供原材料．③表示自然选择学说．②导致③改变的内因是突变和基因重组，外因是自然选择．

　　（3）共同进化是指生物与生物之间，生物与环境之间互影响、不断进化．

　　（4）A．自然选择使种群的基因频率发生定向改变，A正确；

　　B．种群是生物进化的基本单位，B正确；

　　C．物种形成包括突变和基因重组、选择、隔离三个环节，C错误；

　　D．种群中全部个体含有种群基因库的全部基因，D错误．

　　故选：AB．

　　故答案为：

　　（1）基因频率改变 自然选择学说

　　（2）突变和基因重组 自然选择

　　（3）生物与生物之间，生物与环境

　　（4）AB