A、在蛋白质鉴定实验中，稀释的蛋清液加热变性后滴入双缩脲试剂显示紫色，因为加热不会使蛋白质中的肽键断裂，A错误；

　　B、观察同一个紫色洋葱鳞片叶外表皮的不同部位，其质壁分离程度可能不同，因为不同部位细胞中的细胞液浓度不同，B正确；

　　C、平板划线法可以分离微生物，但不能对分离的微生物进行计数，稀释涂布平板法既可以分离微生物，也可以对分离的微生物进行计数，C错误；

　　D、腐乳制作的流程是：让豆腐上长出毛霉、加盐腌制、加卤汤装瓶、密封腌制，为了防止杂菌污染，要逐层加盐，且随着层数的加高而增加盐量，接近瓶口表面的盐要铺厚一些，D错误．

　　故选：B．