（1）图中细胞中，同源染色体正在联会配对形成四分体，因此处于四分体时期；从图中还能看出，2号和3号非姐妹染色单体之间发生过交叉互换，由于该植物的基因型为Aa，如果1号染色单体上的基因为A，则2号上的等位基因最可能是a．

　　（2）该植物体细胞的染色体数目为2N=24．若A基因所在的那一对同源染色体只在减数第一次分裂时不分离，则产生的次级卵母细胞中的染色体数目可能是11条或13条，因此该母本产生的雌配子染色体数目最可能为13或11条，此种变异类型属于可遗传变异中的染色体数目的变异．植物AA（♀）×aa（♂）时，若母本中A基因所在的那一对同源染色体在减数第一次发裂时不分离，则产生的卵细胞的基因型为AA和0，而正常精子的基因型为a，若该卵细胞能顺利受精并发育，则所结种子胚的基因型应该是AAa或a．

　　（3）基因突变是DNA分子中碱基对的替换、增添和缺失引起的基因结构的改变，这样转录的mRNA的序列也可能改变．突变体M第二个密码子中的第二个碱基由C变为U，这样最多只有一个氨基酸种类发生改变，N在第二个密码子的第二个碱基前多了一个U，这样可能后面密码子都会改变，那么氨基酸的种类顺序改变就较大了．

　　故答案为：

　　（1）四分体（或联会）　a

　　（2）13　11　AAa　a　染色体（数目）变异

　　（3）N