A、突变和基因重组为生物进化提供了原材料，种群中存在的可遗传变异是自然选择的前提，也是生物进化的前提，A错误；

　　B、生物进化的实质是种群基因频率的改变，自然选择通过定向改变种群的基因频率使生物朝着一定的方向进化，自然选择不是进化的唯一因素，但却是适应性进化的唯一因素，B正确；

　　C、自然选择不仅能保留有利变异，淘汰不利变异，而且能使有利变异积累起来，C正确；

　　D、长期的地理障碍形成的生殖隔离=是物种形成的主要方式，不是唯一方式，如多倍体的形成不需地理隔离，D正确．

　　故选：A．