根据酶所催化的反应性质的不同,将酶分成六大类：

　　氧化还原酶类（oxidoreductase）

　　促进底物的氧化或还原.

　　转移酶类（transferases）

　　促进不同物质分子间某种化学基团的交换或转移.

　　水解酶类（hydrolases）

　　促进水解反应.

　　裂合酶类（lyases）

　　催化从底物分子双键上加基团或脱基团反应,即促进一种化合物分裂为两种化合物,或由两种化合物合成一种化合物.

　　异构酶类（isomerases）

　　促进同分异构体互相转化,即催化底物分子内部的重排反应.

　　合成酶类（ligase）

　　促进两分子化合物互相结合,同时ATP分子（或其它三磷酸核苷）中的高能磷酸键断裂,即催化分子间缔合反应.按照国际生化协会公布的酶的统一分类原则,在上述六大类基础上,在每一大类酶中又根据底物中被作用的基团或键的特点,分为若干亚类；为了更精确地表明底物或反应物的性质,每一个亚类再分为几个组（亚亚类）；每个组中直接包含若干个酶.