根据题意分析可知，该实验应该是果蝇灰身残翅的实验．重组个体是16%，说明基因不是自由组合的，而是发生了交叉互换．又因为雄果蝇是完全连锁的，不可能出现交叉互换现象；雌果蝇才有交叉互换，所以该题交叉互换的应该是雌性的初级卵母细胞．这是少数的几个完全连锁现象．一个染色体有两个染色单体，如果我们只讨论携带相关基因的染色体，那么最后可以得出：染色单体的数量和雌配子的数量是一致的．雄配子正常，后代16%重组，说明雌配子16%交叉互换，故而染色单体互换的比例是16%．所以如果是染色体发生互换的比例，应该是32%．另外基因的交叉互换发生在减数第一次分裂前期，所以雌果蝇初级卵母细胞在减数分裂时，有16%的染色单体发生互换，84%的染色单体未发生互换．

　　故选：C．