原因很多,说几个最为重要的.

　　1.转录酶的空间结构,由于酶空间结构的特异性导致5-3；

　　2.合成过程中羟基要发生脱水缩合作用,如果是3-5的话羟基之间会有相互作用阻碍该进程；

　　3.从热力学角度来看,5-3合成要在ATP功能下发生脱水缩合使得5-3成为了热力学上的更容易发生的作用.

　　左后说一点：在生物体内也是会发生极少数的3-5合成,但是由于属于热力学不利反应这样的情况极为罕见.