A、基因突变率虽然低，却是生物变异的根本来源，是生物进化的原材料．A正确；

　　B、生物的表现型是基因型与环境共同作用的结果，基因型不同，表现型相同；对环境的适应性相同，也可能表现型不同．对环境的适应性也不同；B正确；

　　C、环境发生的变化如果影响到某些基因型，由于环境的选择作用，就会使种群的基因频率改变；如果环境发生的变化不影响种群中各基因型的适应性，也可能不起选择作用，使基因频率不变．C正确．

　　D、种群内个体之间才有基因交流，所以生物进化的基本单位是种群而非群落．错误．

　　故选：D