A、性染色体上的基因有的可以控制性别，但是也有不控制性别的，如控制色盲的基因在X染色体上，A错误；

　　B、性染色体能控制性别的原因主要减少因为性染色体上有控制性别的基因，B错误；

　　C、女性有两条X染色体，其中一条来自母亲，另一条来自父亲，C正确；

　　D、在正常体细胞中，无论是常染色体还是性染色体，都是成对存在的，并经减数分裂后减半存在于生殖细胞中所以性染色体存在于所有细胞中，在体细胞和生殖细胞中都有性染色体的存在，D错误

　　故选：C．