A、生物分类要根据生物外形和内部结构来划分，A错误．

　　B、生物的分类依据很多，要对生物灵活分类，但是不能根据自己喜好自行分类，B错误．

　　C、有生物分类有助于了解生物的多样性，更好地保护生物的多样性，弄清它们之间的亲缘关系和进化关系，C正确．

　　D、每个界又被分为六个更小的等级．它们由从大到小依次是门、纲、目、科、属、种．如植物界中有若干个门，在一个门里，可能有很多种生物，但是每一个种里，只有一种生物．因此“界”是最大的分类单位，“种”是最基本的分类单位，D错误．

　　故选：C