将待分析的序列装入Channel,点击要分析的Channel,然后通过Restriction/Analysis命令打开对话框.

　　参数说明如下：

　　Results分析结果显示

　　其中包括：

　　Showsummary（显示概要）Showsitesonsequence（在结果中显示酶切位点）

　　Drawrestrictionmap（显示限制性酶切图）Drawrestrictionpattern（显示限制性酶切模式图）

　　Ignoreenzymeswithmorethan（忽略大于某设定值的酶切位点）

　　Ignoreenzymeswithlessthan（忽略小于某设定值的酶切位点）

　　TargetDNA（目标DNA特性）

　　circular（环型DNA）,dam/dcmmethylation（dam/dcm甲基化）

　　参数说明如下：

　　Enzyme

　　代表（enzymedatafile）,点击旁边的下拉按钮,出现两个默认选项,restrict.enz和dnamane.enz,

　　如果添加过自制的酶列表,则附加显示自制酶列表文件名.其中restrict.enz数据文件包含180种

　　限制酶,dnamane.enz数据文件包含2524种限制酶.选择其中一个数据文件,相应的酶在左边的显示框中列出（按酶名称字母表顺序）,鼠标双击酶名称,则对应的酶被选中,在右边空白框中列出.要自制酶切列表,可以从左边酶列表中双击鼠标选择多种酶（例如puc18multiplecloningsites）,然后点击按钮出现下列对话框：输入要保存酶列表的文件名,点击按钮即可保存.自制酶列表可以方便分析特定的酶切位点.

　　Cutter酶切识别序列长度；End酶切产生的末端,其中包括,Blunt（平头末端）,5’Overhang

　　（5’突出粘性末端）,3’Overhang(3’突出粘性末端),系统根据cutter和end的设定情况,在左边酶列表中显示符合条件的酶.最后,点击按钮执行操作.