①人类的47，XYY综合征个体的形成是由于在精子形成过程中，减数第二次分裂的后期，着丝点分裂后形成的两个Y染色体移向了细胞同一极，与同源染色体联会行为无关，错误；

　　②线粒体位于细胞质中，其基因不存在于染色体上；又枯草杆菌是原核生物，没有染色体和线粒体结构，因而枯草杆菌出现抗药性与同源染色体联会行为无关，错误；

　　③三倍体西瓜植株在减数分裂过程中，同源染色体联会紊乱，不能产生正常的生殖细胞，所以高度不育，与同源染色体联会行为有关，正确；

　　④一对等位基因杂合子的测交后代出现1：1的性状分离比，说明等位基因随联会的同源染色体分离而分离，产生数目相等的两种配子，与同源染色体联会行为有关，正确；

　　⑤卵裂时进行的是有丝分裂，不发生减数分裂，所以个别细胞染色体异常分离，可形成人类的21三体综合征个体，与同源染色体联会行为无关，错误．

　　所以与减数分裂中同源染色体联会行为均有关的是③④．

　　故选：C．