A、标志脱落可能导致重捕数统计量的减少，与实际比较，应偏大，A错误；

　　B、调查某遗传病的发病率时应以社会群体为调查对象，若以患者家系为调查对象，计算得出的发病率会偏高，B错误；

　　C、未消毒的种子有微生物，微生物也能进行呼吸作用，所以用未消毒的种子为实验材料测定呼吸速率，所得到数值比实际数值偏大，C错误；

　　D、正常统计时，血球计数板的框格边上的菌体要计算两条相邻的边，所以只统计计数室方格内的菌体，则实验所得到数值比实际数值偏小，D正确．

　　故选：D．