A、根据标志重捕法的计算公式：种群中个体数（N）/标记总数=重捕总数/重捕中被标志的个体数可知，若部分野兔身上的标志物脱落，则会导致重捕中被标志的个体数偏小，最终导致实验所得到数值比实际数值大，A正确；

　　B、正常统计时，血球计数板的框格边上的菌体要计算两条相邻的两边，所以只统计计数室方格内的菌体，则实验所得到数值比实际数值偏小，B错误；

　　C、样方法调查蒲公英种群密度时，应随机取样，而不能在分布较稀疏的地区取样，这样会使计算所得数值偏小，C错误；

　　D、探究土壤中小动物类群丰富度时仅用肉眼对小动物进行观察和分类，会导致所得数值偏小，D错误．

　　故选：A．