细菌可以按照不同的方式分类.

　　1.细菌具有不同的形状.大部分细菌是如下三类：杆菌是棒状；球菌是球形（例如链球菌或葡萄球菌）；螺旋菌是螺旋形.另一细菌

　　类,弧菌,是逗号形.

　　2.细菌的结构十分简单,原核生物,没有膜结构的细胞器例如线粒体和叶绿体,但是有细胞壁.

　　根据细胞壁的组成成分,细菌分为革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌.“革兰氏”来源于丹麦细菌学家革兰(HansChristianGram),他发明了革兰氏染色.有些细菌细胞壁外有多糖形成的荚膜,形成了一层遮盖物或包膜.荚膜可以帮助细菌在干旱季节处于休眠状态,并能储存食物和处理废物.

　　细菌的分类的变化根本上反应了发展史思想的变化,许多种类甚至经常改变或改名.最近随着基因测序,基因组学,生物信息学和计算生物学的发展,细菌学被放到了一个合适的位置.