（1）据题中信息可知，小分子a为脱氧核苷酸，b为氨基酸，故元素X为N、P，元素Y为N．

　　（2）图中大分子物质A为DNA，中文名称是脱氧核糖核酸，其彻底水解产物是核苷酸的组成成分，故为磷酸、脱氧核糖、碱基，DNA可被甲基绿染成绿色，故观察时可用甲基绿染色．

　　（3）蛋白质分子的多样性是由于氨基酸种类、数量、排列排序不同及蛋白质的空间结构不同导致的．

　　（4）物质D为糖蛋白，在细胞中的存在部位是细胞膜的外侧．

　　故答案为：

　　（1）N、P　N

　　（2）脱氧核糖核酸　磷酸、脱氧核糖、含氮碱基　甲基绿染液

　　（3）b种类、数量、排列顺序不同

　　（4）糖蛋白　细胞膜的外侧