简单的说：

　　独立基础是完整的计算,不需要扣除.

　　条形基础与独立基础相交的部分,不计算.

　　相交部分归独立基础.

　　那如果条基上有基础墙，独立基础上有柱的话那是不是基础墙的下部分算至承台的侧面而基础墙部分算至柱的侧面？

　　是的。建议你去看看计算规则。定额与清单计算规则。