（1）∵二次函数y=（a-1）x2+2x+1与x轴有交点，

　　令y=0，则（a-1）x2+2x+1=0，

　　∴△=4-4（a-1）≥0，解得a≤2．

　　∵a为正整数，

　　∴a=1、2

　　又∵y=（a-1）x2+2x+1是二次函数，∴a-1≠0，∴a≠1，

　　∴a的值为2．

　　（2）∵a=2，

　　∴二次函数表达式为y=x2+2x+1，将二次函数y=x2+2x+1化成顶点式y=（x+1）2，二次函数图象向右平移m个单位，向下平移m2+1个单位后的表达式为y=（x+1-m）2-（m2+1）．此时函数的顶点坐标为（m-1，-m2-1）．

　　当m-1<-2，即m<-1时，x=-2时，二次函数有最小值-3，

　　∴-3=（-1-m）2-（m2+1），解得m=-32