A、⑤是细胞核，细胞核是遗传和代谢的控制中心，细胞核不是细胞代谢的中心，A错误；

　　B、该细胞的生物膜系统包括细胞膜、细胞器膜和核膜，③是线粒体、④是高尔基体、⑧叶绿体都属于该细胞的生物膜系统，B正确；

　　C、②是液泡，含有花青素，与花瓣的颜色有关，C正确；

　　D、真核细胞中，能发生碱基互补配对现象的过程有DNA分子的复制、转录和翻译过程，③是线粒体含有DNA和RNA、能进行DNA复制和转录，⑤是细胞核，是DNA复制和转录的主要场所，⑦核糖体是翻译的过程的场所，⑧叶绿体含有DNA和RNA，能进行DNA的复制和转录，所以③⑤⑦⑧结构中能发生碱基互补配对现象，D正确．

　　故选：A．