A．金刚石属于原子晶体，晶体中原子以共价键结合，形成空间网状结构，白磷是分子晶体，晶体中原子以共价键结合，形成正四面体结构，但不是空间网状结构，故A错误；

　　B．CO2晶体属于分子晶体，SiO2晶体属于原子晶体，二者都由共价键形成，晶体类型变化，故B错误；

　　C．共价化合物只有含有共价键，含有离子键一定属于离子化合物，离子化合物可以含有共价键，故C错误；

　　D．NH4Cl由铵根离子与氯离子通过离子键形成，铵根离子中N原子与H原子之间形成共价键，故D正确；

　　故选D．