相同点：通过连续多代进行,都使后代群体基因型趋于纯合,且纯合率公式也相同.

　　不同点：

　　（1）纯合基因型种类：回交是轮回亲本一种纯合基因型；而自交有2n种纯合基因型.

　　（2）纯合进度：回交比自交快得多,因回交中的纯合率（A）是指轮回亲本一种纯合基因型的所占的比例；而自交后代中的A是2n种纯合基因型的纯合率的总和.