A、在“验证绿叶在光下合成淀粉”的实验中，选做实验的植物已经进行了光合作用，里面储存了丰富的有机物．如不除去会对实验结果造成影响．所以在实验前应将植物放在黑暗处一昼夜的目的是通过呼吸作用将天竺葵叶片中贮存的淀粉运走耗尽，A正确．

　　B、乙组装置与乙组装置的区别是丙里面是清水，丙里面是氢氧化钠溶液，由于氢氧化钠溶液能吸收空气中的二氧化碳，而清水没有此功能，故乙、丙两装置内乙里面有二氧化碳，丙里面没有二氧化碳．因此乙、丙两装置中的叶片所处的环境，惟一变量是二氧化碳，B正确．

　　C、光合作用的条件是光照，甲装置中叶片缺少光照，不能进行光合作用，丙内氢氧化钠溶液吸收二氧化碳，因此甲、乙、丙瓶中的叶片经脱色、染色后，理论上只有乙瓶中的叶片变蓝色，C正确．

　　D、将如图叶片暗处理、割断叶脉、光下照射、脱色、碘液染色后观察：A区不变蓝色，B区变蓝色，证明水是光合作用的原料，丁叶片没有经过暗处理，D错误．

　　故选：D