由一个受精卵发育而来的猫，每个细胞中应含有相同的遗传物质，这就决定这只猫两只眼的眼色应是一样，而事实表现出不一样：一只黄色、一只蓝色，黄色与蓝色是一对相对性状，由一对等位基因控制，等位基因的出现是基因突变的结果，因此这种性状的出现是基因突变的结果

　　A、黄色和蓝色是一对相对性状，一只猫一只黄色的眼睛和一只蓝色的眼睛最可能的原因是发生基因突变，A错误；

　　B、基因重组是控制不同性状的基因重新组合，该题只涉及一个性状，即猫眼的颜色，因此不是基因重组，B错误；

　　C、黄色和蓝色是一对相对性状，由等位基因控制，基因突变能产生等位基因，因此一只猫一只黄色的眼睛和一只蓝色的眼睛最可能的原因是发生基因突变，C正确；

　　D、该题没有涉及诱发变异因素，D错误．

　　故选：C．