A、生物体进行有性生殖的过程中控制不同性状的基因的重新组合，而细菌只能进行无性繁殖，则不能发生基因重组，故A错误；

　　B、细菌属于原核细胞，DNA没有与蛋白质组合形成染色体，则没有染色体结构变异，故B错误；

　　C、细菌属于原核细胞，遗传物质是DNA，在DNA复制的过程中容易发生基因突变，故C正确；

　　D、细菌没有染色体，则不能发生染色体数目的变异，故D错误．

　　故选：C．