A、由于密码子的简并性等原因，基因突变不一定会改变生物的性状，A错误；

　　B、发生在生物体体细胞内的基因突变一般不能传给子代，但发生在生殖细胞中的基因突变可遗传给后代，因此基因突变属于可遗传的变异，B错误；

　　C、基因重组可以产生新的基因型，是生物变异的重要来源．在减数第一次分裂前期，同源染色体上非姐妹单体之间的交叉互换；减数第一次分裂后期，非同源染色体上非等位基因之间的自由组合，都说明减数分裂过程中会发生基因重组，因而一般发生在有性生殖的过程中，C正确；

　　D、基因突变是指基因中碱基对的增添、缺失或替换，在减数分裂间期，果蝇Ⅱ号染色体上缺失了一个碱基对，这种变异属于基因突变，D错误．

　　故选：C．