衣藻和蓝藻最大最根本的区别就是,衣藻是真核生物,蓝藻是原核生物.

　　原核生物（Procaryoticorganism）

　　是由原核细胞组成的生物,包括蓝细菌、细菌、古细菌、放线菌、立克次氏体、螺旋体、支原体和衣原体等.原核生物具有以下的特点：①核质与细胞质之间无核膜因而无成形的细胞核；②遗传物质是一条不与组蛋白结合的环状双螺旋脱氧核糖核酸（DNA）丝,不构成染色体（有的原核生物在其主基因组外还有更小的能进出细胞的质粒DNA）；③以简单二分裂方式繁殖,无有丝分裂或减数分裂；④没有性行为,有的种类有时有通过接合、转化或转导,将部分基因组从一个细胞传递到另一个细胞的准性行为（见细菌接合）；⑤没有由肌球、肌动蛋白构成的微纤维系统,故细胞质不能流动,也没有形成伪足、吞噬作用等现象；⑥鞭毛并非由微管构成,更无“9＋2”的结构,仅由几条螺旋或平行的蛋白质丝构成；⑦细胞质内仅有核糖体而没有线粒体、高尔基器、内质网、溶酶体、液泡和质体（植物）、中心粒（低等植物和动物）等细胞器；⑧细胞内的单位膜系统除蓝细菌另有类囊体外一般都由细胞膜内褶而成,其中有氧化磷酸化的电子传递链（蓝细菌在类囊体内进行光合作用,其他光合细菌在细胞膜内褶的膜系统上进行光合作用；化能营养细菌则在细胞膜系统上进行能量代谢）；⑨在蛋白质合成过程中起重要作用的核糖体散在于细胞质内,核糖体的沉降系数为70S；⑩大部分原核生物有成分和结构独特的细胞壁等等.总之原核生物的细胞结构要比真核生物的细胞结构简单得多.

　　70年代分子生物学的资料表明：产甲烷细菌、极端嗜盐细菌、极端耐酸耐热的硫化叶菌和嗜热菌质体等的16SrRNA核苷酸序列,既不同于一般细菌,也不同于真核生物.此外,这些生物的细胞膜结构、细胞壁结构、辅酶、代谢途径、tRNA和rRNA的翻译机制均与一般细菌不同.因而有人主张将上述的生物划归原核生物和真核生物之外的“第三生物界”或古细菌界.

　　与真核生物的种类相比,已发现的原核生物种类虽不甚多,但其生态分布却极其广泛,生理性能也极其庞杂.有的种类能在饱和的盐溶液中生活；有的却能在蒸馏水中生存；有的能在0℃下繁殖；有的却以70℃最适温度；有的是完全的无机化能营养菌,以二氧化碳为唯一碳源；有的却只能在活细胞内生存.在行光合作用的原核生物中,有的放氧,有的不放氧；有的能在PH为10以上的环境中生存,有的只能在PH为1左右的环境中生活；有的只能在充足供应氧气的环境中生存,而另外一些细菌却对氧的毒害作用极其敏感.有的可利用无机态氮,有的却需要有机氮才能生长；还有的能利用分子态氮作为唯一的氮源等.

　　原核细胞

　　原核细胞procaryotic/prokaryoticcell指没有核膜且不进行有丝分裂减数分裂无丝分裂的细胞.这种细胞不发生原生质流动,观察不到变形虫样运动.鞭毛(flagellum)呈单一的结构.光合作用、氧化磷酸化在细胞膜进行,没有叶绿体(chloroplast)、线粒体(mitochondrion)等细胞器(organelles)的分化.由这种细胞构成的生物,称为原核生物,它包括所有的细菌和蓝藻类.即构成细菌和蓝藻等低等生物体的细胞.它没有真正的细胞核(nucleus),只有原核或拟核,所含的一个基因带(或染色体),是环状双股单一顺序的脱氧核糖核酸分子(circularDNA),没有组蛋白(histone)与之结合无核仁(nucleolus),缺乏核膜(nuclearenvelope).外层原生质中有70S核糖体与中间体,缺乏高尔基体(Golgi)、内质网(E.R.)、线粒体和中心体(centrosomes)等.转录和转译(transcriptionandtranslation)同时进行,四周质膜内含有呼吸酶.无有丝分裂(mitosis)和减数分裂(meiosis),脱氧核糖核酸(DNA)复制后,细胞随即分裂为二.

　　结构含有capsule,mureincellwall,cellsurfacemembrane,circularDNA,mesosome,thykoloid,energystorage(e.g.glycogen),ribosome,flagellum,pilli

　　真核生物

　　eukaryotes

　　由真核细胞构成的生物.包括原生生物界、真菌界、植物界和动物界.真核细胞与原核细胞的主要区别是：①真核细胞具有由染色体、核仁、核液、双层核膜等构成的细胞核；原核细胞无核膜、核仁,故无真正的细胞核,仅有由核酸集中组成的拟核.②真核细胞的转录在细胞核中进行,蛋白质的合成在细胞质中进行,而原核细胞的转录与蛋白质的合成交联在一起进行.③真核细胞有内质网、高尔基体、溶酶体、液泡等细胞器,原核细胞没有.④真核生物中除某些低等类群（如甲藻等）的细胞以外,染色体上都有5种或4种组蛋白与DNA结合,形成核小体；而在原核生物则无.⑤真核细胞在细胞周期中有专门的DNA复制期（S期）；原核细胞则没有,其DNA复制常是连续进行的.⑥真核细胞的有丝分裂是原核细胞所没有的.⑦真核细胞有发达的微管系统,其鞭毛（纤毛）、中心粒、纺锤体等都与微管有关,原核生物则否.⑧真核细胞有由肌动、肌球蛋白等构成的微纤维系统,后者与胞质环流、吞噬作用等密切相关；而原核生物却没有这种系统,因而也没有胞质环流和吞噬作用.⑨真核细胞的核糖体为80S型,原核生物的为70S型,两者在化学组成和形态结构上都有明显的区别.⑩真核细胞含有的线粒体,为双层被膜所包裹,有自己特有的基因组、核酸合成系统与蛋白质合成系统,其内膜上有与氧化磷酸化相关的电子传递链.原核细胞功能上与线粒体相当的结构是质膜和由质膜内褶形成的结构,但后者既没有自己特有的基因组,也没有自己特有的合成系统.真核生物的植物含有叶绿体,它们亦为双层膜所包裹,也有自己特有的基因组和合成系统.与光合磷酸化相关的电子传递系统位于由叶绿体的内膜内褶形成的片层上.原核生物中的蓝细菌和光合细菌,虽然也具有进行光合作用的膜结构,称之为类囊体,散布于细胞质中,未被双层膜包裹,不形成叶绿体.

　　最原始的真核生物的直接祖先很可能是一种异常巨大的原核生物,体内具有由质膜内褶而成的象内质网那样的内膜系统和原始的微纤维系统,能够作变形运动和吞噬.以后内膜系统的一部分包围了染色质,于是就形成了最原始的细胞核.内膜系统的其他部分则分别发展为高尔基体、溶酶体等细胞器.按照美国学者L.马古利斯等重新提出的“内共生说”（见细胞起源）,线粒体起源于胞内共生的能进行氧化磷酸化的真细菌,而叶绿体则起源于胞内共生的能进行光合作用的蓝细菌.

　　美国学者R.W.惠特克1969年把真核生物分为5界即：原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界和动物界.原生生物界包括原生动物、单细胞藻类和单细胞真菌.真菌界营腐生或寄生生活,多数种类细胞有几丁质的壁,菌体多由菌丝组成.植物界有叶绿体,能进行光合作用,细胞有纤维素的壁.动物界营摄食或捕食生活,多数种类能运动,细胞无壁,有复杂的胚胎发育过程.这种分法现