由题意知，人体是二倍体，甲的基因型为AaB，乙的基因型为AABb，甲缺少一个基因可能是甲缺少一条染色体，或者甲的该染色体片段缺失．

　　A、染色体结构变异是可能的原因之一，A正确；

　　B、染色体数目变异是可能的原因之一，B正确；

　　C、甲缺少一个基因不可能是基因突变，因为基因突变不会导致基因数量变化，C错误；

　　D、甲缺少一个基因不可能是基因重组，因为基因重组不会导致基因数量变化，D错误．

　　故选：CD．