这个句子是这样的Theonlylimitationis(that)iftheuserdoesnotthinkhisorhermessageclearly,anunclearlymessagemaybesent.或者这样改写Theonlylimitationis(that)anunclearlymessagema...

　　表语从句不是不省that吗？是不是如果有别的引导词，就可以了？

　　确实一般不省，但不是绝对，特别是在不影响文意和比较随意的文章中还是有时会发现有省略的情况。你讲的这个理由有一定道理，因为is和if在这里明显表示以下是从句，而if是不用来引导表语从句的，表语从句用whether。