（1）由题意知，雌果蝇的重棒眼出现的原因是两条X染色体上各有2个“16A区段”，其中1条X染色体上1个“16A区段”发生不对等交换，由图1分析可知，发生

　　不对等交换后，1条X染色体上1个“16A区段”转移到另一条X染色体上，因此一条X染色体上有1个“16A区段”，另一条X染色体上有3个“16A区段”．

　　（2）分析逆转录转座基因重复机制可知，人类1000多个嗅觉基因可能是通过逆转录转座基因重复机制形成的；许多嗅觉基因成为无功能的“基因”可能是由基因突变导致的；人类嗅觉基因退化从进化的角度看是长期自然选择的结果．

　　（3）所有核基因的数目增加一倍的原因是染色体数目加倍．

　　（4）分析题意可知，GLUD1基因是通过逆转录转座产生的，分析题图可知，逆转录转座存在转录和逆转录过程，转录过程需要RNA聚合酶的催化，逆转录过程需要逆转录酶催化；谷氨酸脱氢酶主要分布于肝、肾、脑等组织中，这是细胞分化的结果，细胞分化的实质是基因的选择表达；谷氨酸脱氢酶的基因是通过控制谷氨酸脱氢酶的合成控制细胞代谢，进而控制生物的性状．

　　故答案为：

　　（1）1条X染色体上有3个“16A区段”，另1条X染色体上有1个“16A区段”

　　（2）逆转录转座 基因突变 自然选择

　　（3）染色体数目加倍

　　（4）RNA聚合酶和逆转录酶 选择性表达 基因通过控制酶的合成来控制代谢过程