分为原核微生物和真核微生物和非细胞型微生物(病毒亚病毒)

　　原核微生物包括:细菌放线菌蓝细菌(即蓝藻)支原体衣原体立克次氏体

　　真核微生物包括:酵母菌霉菌

　　非细胞型微生物包括:病毒和亚病毒.病毒常见的有噬菌体植物病毒脊椎动物病毒昆虫病毒.亚病毒常见的有类病毒拟病毒朊病毒.