微生物在碳素循环中的作用:

　　把有机物中的碳元素尽快矿化和释放,从而使生物圈处于一种良好的碳平衡循环中.地球上约90%的CO2是由微生物分解作用形成的.

　　微生物在硫素循环中的作用：

　　在无氧条件下,通过一些腐败微生物的作用,把生物体中蛋白质等含硫有机物中的硫分解成H2S等含硫气体的作用.

　　微生物在氮素循环中的作用：

　　生物固氮据70年代中期的统计全球生物圈每年生物固氮达2.4108吨,其中60%由陆生固氮生物完成,40%由海洋固氮生物完成.

　　根瘤菌属每年可为每公顷土地固氮达250Kg.

　　氨态氮经硝化细菌的氧化,转变为硝酸态氮.

　　绿色植物和微生物在利用硝酸盐的过程中,硝酸盐被重新还原成NH4+后再被利用于合成各种含氮有机物.

　　含氮有机物必须经过微生物降解才能被植物利用.

　　所有绿色植物和微生物进行的以铵盐作为营养,合成氨基酸,蛋白质,核酸和其它含氮有机物.

　　可以利用水生性反硝化细菌去除污水中的硝酸盐.

　　亚硝酸通过异化性还原可以经羟胺转变成氨.

　　微生物的分解作用:

　　光合作用固定的CO2中大部分以聚糖形式积累于木本和草本植物躯干中,木材占60%,其中75%是纤维素,约20%是木质素和木聚糖,蛋白质仅占1%左右.在草本植物中多糖含量更高.分解纤维素的任务就是由土壤中的一些特殊微生物来完成的.