关键是你对微生物怎样下定义.

　　一般来说,微生物包括细菌、真菌、病毒和类病毒等生物.真菌虽然是真核生物,但真菌都是异养生物,没有叶绿体,不进行光合作用.细菌、病毒都不属于真核生物,更加不可能有叶绿体了.光合细菌（如蓝藻）也只含叶绿素而不具有叶绿体.

　　但现代对微生物的定义是一切肉眼看不见或看不清的微小生物的总称.也包括原生生物,即单细胞的植物和单细胞的动物.

　　单细胞的植物（单细胞藻类）是含有叶绿体的.

　　所以,要回答你这个问题决定于你选哪个微生物的定义.