（1）蛋白质的消化是从胃开始的，当食物中的蛋白质进入胃以后，在胃液的作用下进行初步消化后进入小肠，小肠里的胰液和肠液含有消化蛋白质的酶，在这些酶的作用下，蛋白质被彻底消化为氨基酸．可见图中②表示蛋白质的消化．消化道中吸收氨基酸的主要器官是小肠．

　　（2）氨基酸被小肠吸收进入血液循环后，经下腔静脉进入右心房，需要通过肺循环再回到心脏的左心房、左心室，最后进入主动脉．具体路线是：小肠毛细血管→小肠静脉→肝门静脉→体静脉→下腔静脉→右心室→肺动脉→肺部毛细血管网→肺静脉→左心房→左心室→主动脉．

　　（3）尿液的形成经过肾小球和肾小囊内壁的滤过作用和肾小管的重吸收作用．当血液流经肾小球时，除了血细胞和大分子的蛋白质外，血液中其他物质都会滤过到肾小囊腔形成原尿．当原尿流经肾小管时，其中对人体有用的物质，包括大部分水、全部葡萄糖和部分无机盐，被肾小管重吸收，剩下的废物形成尿液，排出体外．

　　故答案为：（1）②；小肠；

　　（2）④；体循环；

　　（3）肾小球；重吸收．