A、在物质循环过程中伴随着能量流动，不能循环流动，物质是能量的载体，A错误；

　　B、只有当空气中二氧化碳达到能够产生光合作用的最低浓度时，光合作用固定的碳与植物呼吸作用释放的碳相等，一般情况下光合作用固定的碳大于植物呼吸作用的碳，B错误；

　　C、生态系统的抵抗力稳定性与生态系统的成分和营养结构有关，生态系统的成分越单纯，营养结构越简单，自动调节能力越小，抵抗力稳定性越低．故增加生态系统内各营养级生物的种类可增加生态系统抵抗力稳定性，C正确；

　　D、能量流动和物质循环是同时进行的，二者彼此依存，D错误．

　　故选：C．