WTO的最高决策权力机构是部长会议,至少每两年召开一次会议.下设总理事会和秘书处,负责世贸组织日常会议和工作.总理事会设有货物贸易、非货物贸易（服务贸易）、知识产权三个理事会和贸易与发展、预算两个委员会.总理事会还下设贸易政策核查机构,他监督各个委员会并负责起草国家政策评估报告.对美国、欧盟、日本、加拿大每两年起草一份政策评估报告,对最发达的16个国家每4年一次,对发展中国家每6年一次.上诉法庭负责成员间发生的分歧进行仲裁.