A、流入该生态系统的总能量是生产者所固定的太阳能，图中更可以看出，生产者固定的太阳能为464.6，故A错误；

　　B、流入该生态系统的总能量主要有三个去向：呼吸作用消耗、流向分解者、未被利用，很显然未被利用的这部分能量还留在该生态系统中，因此流入该生态系统的总能量大于流出该生态系统的总能量，故B错误；

　　C、第二营养级同化的能量为62.8，第三营养级同化的能量为12.6，因此能量传递效率=12.6/62.8×100%=20%，故C正确；

　　D、该生态系统中的食物链主要为捕食链，故D错误．

　　故选C．